课程介绍
- 2025年秋季课程预告
- 改为使用Python语言
- 参考教材：《Python机器学习基础教程》, 《统计学习导论-基于Python》
- 安装Anaconda （或Miniconda）和JupyterLab：用于数据处理和分析的Python安装版，预装了NumPy、SciPy、matplotlib、scikit-learn等包。
- 课程作业：多元回归、表达谱分析和聚类、scRNA-seq分析、网络分析、深度学习
- 《基因组学数据分析》课程面向生物信息和湿实验室同学，学习R语言、统计模型，并练习组学数据分析。
- 2024年秋季开课信息：9月10日开始，每周二下午3:10-5:00，北京大学理教306。
- 欢迎选课或旁听，课程号：本科01133037，研究生01108148
- 参考教材：《统计学习导论-基于R应用》中文版，英文版
科研方法
2022-2024年秋季课件
01、课程和R语言介绍
【助教演示1】初步认识Rstudio
02、线性回归、分布图
03、多元线性回归、作图颜色
04、分类数据与富集
05、RNA-seq转录组分析
【助教演示2】Linux系统及RNA-seq环境搭建与分析
06、主成分分析和聚类
07、癌症基因组学、生信分析网站
08、高维数据回归、交叉验证
09、开放染色质、三维基因组
10、分类预测模型
11、单细胞转录组
【助教演示3】单细胞转录组分析和作图
12、网络生物学、置换检验
13、算法与编程优化
14、蛋白质组学
15、细胞可塑性与调控预测
16、深度学习模型
17、矩阵特征向量和分解