课程

课程介绍

• 《基因组学数据分析》课程面向生物信息和湿实验室同学，学习R语言、统计模型，并练习组学数据分析。
• 2024年秋季开课信息：9月10日开始，每周二下午3:10-5:00，北京大学理教306。
• 欢迎选课或旁听，课程号：本科01133037，研究生01108148
• 参考书：《统计学习导论》中文版（京东），英文版
• 课外材料：
  • R1. 文献跟踪与学习
  • R2. 组学课题、作图与文稿设计
  • R3. 课题管理与时间管理
  • R4. 数据分析误区与规范
  • R5. 学术报告与学术交流

2022-2024年秋季课件

【2023年作业1-3、大作业布置；习题课】https://share.weiyun.com/CNfPERd3
1、课程和R语言介绍：https://share.weiyun.com/pkNUVdjH
【助教演示1】初步认识Rstudio
2、线性回归、分布图：https://share.weiyun.com/JzMmMgVz
3、多元线性回归、作图颜色：https://share.weiyun.com/vDzv7smK
4、分类数据与富集：https://share.weiyun.com/tqnxSma7
5、RNA-seq转录组分析：https://share.weiyun.com/zda5Z9yo
【助教演示2】Linux系统及RNA-seq环境搭建与分析
6、主成分分析和聚类：https://share.weiyun.com/R66hYhkf
7、癌症基因组学、生信分析网站：https://share.weiyun.com/LOzu6d0A
8、高维数据回归、交叉验证：https://share.weiyun.com/G8lIdZ2c
9、开放染色质、三维基因组：https://share.weiyun.com/a8NI90xL
10、分类模型：https://share.weiyun.com/YTUb1p7W
11、单细胞转录组：https://share.weiyun.com/B3SoJb9U
【助教演示3】单细胞转录组分析和作图
12、网络生物学、置换检验：https://share.weiyun.com/MbxceJMw
13、算法与编程优化：https://share.weiyun.com/ImxoeqcZ
14、深度学习模型：https://share.weiyun.com/F5bVR6i7

2022年秋季课件

【2022年作业1-4布置】https://share.weiyun.com/7bqLcHr2
14、蛋白质组学：https://share.weiyun.com/2yMETial
15、细胞可塑性与调控预测：https://share.weiyun.com/RizXPZi7